Thành lậpKhoa Phẫu thuật tổng hợp được thành lập từ những ngày đầu thành lập Bệnh viện năm 1970. Đến năm 1980, Khoa Phẫu thuật tiêu hóa B được tách ra từ Khoa Phẫu thuật tổng hợp. Năm 1983 Khoa Phẫu thuật tiêu hóa M được thành lập. Do nhu cầu phát triển của bệnh viện, đến ngày 6/11/2014, hai Khoa Phẫu thuật tiêu hóa B và Khoa Phẫu thuật tiêu hóa M sáp nhập thành Khoa Ngoại tiêu hóa. Trong quá trình phát triển, nhiều bác sĩ của khoa đã trở thành lãnh đạo chủ chốt của các bệnh viện trong ngành y tế Thủ đô.
Lãnh đạo tiền nhiệm
Khoa Phẫu thuật Tiêu hóa B
PGS.TS.BS. Nguyễn Mậu Anh
BS. Phạm Gia Thoại
BSCKII. Ngô Văn Tiệp
TS.BS. Lê Ngọc Quỳnh
TS.BS. Trịnh Tùng
BSCKII. Đoàn Hữu Đông
TS.BS. Lê Minh Sơn
Khoa Phẫu thuật Tiêu hóa M
BS. Nguyễn Hữu Ninh
TTND.BS. Lê Văn Điềm
BSCKII. Bùi Văn Hòa
Nhân sự hiện tại
Trưởng khoa: ThS.BS. Trần Kiên Quyết
Phó Trưởng khoa: ThS.BS. Nguyễn Ngọc Đan
Điều dưỡng trưởng: CN. Nguyễn Thị An
Nhân sự gồm có: 38 nhân viên
• 14 Bác sĩ: 01 tiến sĩ, 05 thạc sĩ, 02 BSCKI, 6 đại học
• 22 Điều dưỡng: 05 cử nhân đại học, 09 điều dưỡng cao đẳng, 8 điều dưỡng trung cấp
• 02 Hộ lý


Thành tích đã đạt được
Trải qua các thời kỳ phát triển khoa đã đạt được những thành công đáng ghi nhận. Số lượng bệnh nhân đến khám, điều trị nội trú và phẫu thuật ngày càng tăng. Các bệnh lý được điều trị tại khoa bao gồm từ các bệnh về ung thư đường tiêu hóa, thực quản, dạ dày, đại trực tràng, bệnh lý vùng hậu môn, bệnh lý gan - mật - tụy, bệnh lý phụ khoa…
Những kỹ thuật mũi nhọn của khoa là phẫu thuật nội soi (PTNS) đặc biệt là PTNS hoàn toàn cắt dạ dày kèm nạo vét hạch trong ung thư dạ dày - ung thư đại trực tràng, nội soi tán sỏi đường mật bằng Laser, phẫu thuật cắt u
thực quản nội soi, cắt khối tá tụy.
Hàng năm khoa Phẫu thuật Tiêu hóa thường xuyên có các bài báo cáo trong các Hội nghị Ngoại khoa của toàn quốc. Nhiều chuyên gia nước ngoài đã đến khoa Phẫu thuật Tiêu hóa Bệnh viện Xanh Pôn để làm việc. Khoa tham gia công tác giảng dạy, chỉ đạo tuyến. Nhiều lượt sinh viên, bác sỹ, các viện, trường đã đến khoa thực tập.

Định hướng phát triển
Lấy người bệnh làm trung tâm, phát triển các kỹ thuật phẫu thuật nội soi chuyên sâu trong điều trị bệnh lý ung thư đường tiêu hóa, phẫu thuật nội soi kèm tán sỏi đường mật trong mổ, đem lại sự hài lòng cho người bệnh.
Tiếp tục học hỏi, nâng cao trình độ chuyên môn, nâng cao kỹ năng giao tiếp, thái độ tiếp xúc người bệnh.